Ở ĐBSCL có khá nhiều giống địa phương do trước đây nhà vườn nhân giống bằng phương pháp hữu tính, nên tỷ lệ phân ly rất cao. Trong những năm gần đây, các giống có chất lượng cao được phổ biến và áp dụng kỹ thuật nhân giống vô tính nên nhà vườn có xu hướng chọn giống đáp ứng được nhu cầu của thị trường, có giá bán cao và thay thế dần các giống địa phương kém chất lượng, giá bán thấp. Tại huyện Cai Lậy trước đây nông dân trồng chủ yếu là giống sầu riêng Khổ qua xanh nhưng hiện nay có 83% hộ nông dân trồng giống sầu riêng Ri6, chỉ có 3% hộ còn giữ giống sầu riêng Khổ qua xanh. Một số giống sầu riêng địa phương trồng khá phổ biến nhất hiện nay là R 6. Ngoài ra, mặc dù ít phổ biến hơn, chủ yếu trồng ở Cai Lậy, Tiền Giang nhưng hai giống sầu riêng Chuồng bò hạt lép và sáu Hữu là giống có phẩm chất ngon, rất được ưa chuộng.
Sầu riêng ‘’Khổ qua xanh’’
Là giống địa phương được trồng phổ biến ở huyện Cai Lậy, tỉnh Tiền Giang. Cây sinh trưởng mạnh, cành nhánh sum xuê. Trái dạng hình thoi, trọng lượng trung bình 1.4 – 1.6 kg, vỏ màu vàng khi chín, cơm mỏng, béo vừa, ngọt hơn đắng nhưng rất thơm, tỷ lệ cơm thấp (19 – 20%) và tỷ lệ hạt chắc rất cao (18 – 19%). Thời gian từ khi đậu trái đến khi thu hoạch tương đối ngắn, từ 95 -100 ngày. Ưu điểm của giống này là dễ ra hoa, đậu trái, năng suất cao, trung bình từ 120 -150 trái/cây 10 – 15 năm tuổi nhưng có nhược điểm là cơm có màu vàng nhạt, hơi ‘’nhẫn”, cơm dễ bị nhão sau những trận mưa lớn. Do phẩm chất không cao, giá bán thấp nên nhà vườn dần thay thế bằng các giống khác có phẩm chất ngon hơn.
Sầu riêng ‘’Cơm vàng sữa hạt lép’’ (Sữa hạt lép Chín Hóa)
Sầu riêng Cơm vàng sữa hạt lép hay còn gọi là sầu riêng Chín Hóa, là giống địa phương, của ông Nguyễn Văn Hóa ngụ tại xã Vĩnh Thành, huyện Chợ Lách, tỉnh Bến Tre. Cây đầu dòng được trồng từ năm 1977, đạt giải A hội thi cây sầu riêng giống tốt do Trung tâm Cây ăn quả Long Định, Hội Làm vườn và Cục Khuyến nông – Khuyến Lâm tổ chức ngày 17/6/1996, được Bộ Nông nghiệp và Phát triển Nông thôn công nhận chính thức vào năm 2004
Trái có hình trụ, vỏ trái màu vàng cám, trọng lượng trung bình từ 2.0 – 2.5 kg. Thịt trái có màu vàng rơm, rất béo, ngọt, cơm hơi mềm nhưng không dính tay, thời gian từ khi đậu trái đến khi thu hoạch từ 100 – 110 ngày. Ưu điểm lớn nhất là hạt bị lép với tỷ lệ 30 – 40%, tỷ lệ được ăn cao hơn sầu riêng Khổ qua xanh (25 – 34%). Nhược điểm là hơi bị nhão cơm, nhất là trong mùa mưa tương đối khó ra hoa, tỷ lệ ra hoa không cao như sầu riêng Khổ qua xanh, năng suất trung bình 50 – 70 trái/cây/năm. Hiện nay, giống này không được thị trường ưa chuộng do thịt trái hơi mềm hay bị nhão.
Sầu riêng ‘’Ri 6’’
Là giống địa phương của ông NGuyễn Minh Châu (6 Ri) ở xã BÌnh Hòa Phước, huyện Long Hồ, tỉnh Vĩnh Long đạt giải A trong hội thi trái ngon lần 2 ngày 8/6/1999 tại VIện Cây ăn quả Miền Nam. Cây sầu riêng Ri 6 được Bộ NN&PTNT công nhận tạm thời theo Quyết định số 5309/QĐ/BNN-KHCN ngày 29/11/2002. Cây sinh trưởng khá tốt, phân cành ngang đều đẹp, dạng tán cây hình tháp rộng, cây đầu dòng 14 năm tuổi cho năng suất 220 kg/cây/năm. Trái có dạng hình elip, có trọng lượng trung bình từ 2.5 -3.0 kg, năng suất trung bình 50 – 70 trái/cây/năm cây từ 10 – 15 năm tuổi, thời gian từ khi đậu trái đến khi thu hoạch trung bình từ 100 – 105 ngày. Ưu điểm lớn nhất của giống này là tỷ lệ hạt lép so với trọng lượng trái rất thấp (5 – 7%), cơm dày, tỷ lệ thịt trái khá cao, gần 30 – 35%, Brix cao (27,3%), màu vàng đậm, vị ngọt, béo, cơm ráo, không xơ và không bị mềm như giống cơm vàng sữa hạt lép. Nhược điểm lớn nhất của giống này là cơm có hiện tượng’’ cháy múi’’. Giống sầu riêng ri 6 là cùng với giống sầu riêng Monthong là hai giống sầu riêng được trồng phổ biến ở các tỉnh ĐBSCL, miền ĐNB và Tây Nguyên.
Sầu riêng Chuồng bò hạt lép
Sầu riêng Chuồng bò hạt lép là giống sầu riêng được chọn từ cây sầu riêng trồng kế bên chuồng bò của ông Nguyễn Văn Trung (Tư Tây) tại ấp Hòa Thịnh, xã ngũ Hiệp, huyện Cai Lậy, tỉnh Tiền Giang nên được đặt tên là ‘’Chuồng bò hạt lép’’. Cây sầu riêng đầu dòng này đạt giải A tại Hội thi Cây sầu riêng tốt do Trung tâm Cây ăn quả Long Định, Hội Làm vườn Việt Nam và Cục Khuyến nông – Khuyến lâm tổ chức ngày 17/6/2006. Cây sinh trưởng mạnh, tán cây hình tháp. Cây ra hoa mạnh, cho năng suất khá cao, cây 6 năm tuổi có khả năng suất 60kg/cây/năm
Trái sầu riêng Chuồng bò hạt lép có hình trụ, gai ngắn, vỏ mỏng (0.33 cm ở giữa vỏ), trọng lượng trung bình 1.5 kg. Cơm trái có màu vàng nhạt, mềm, mịn, hơi ráo đến nhão, hàm lượng nước trong cơm khá cao (81%), vị ngọt, ít béo, Brix trung bình 23%, tỷ lệ thịt trái trung bình 33%, tỷ lệ hạt lép 28%. Thời gian từ khi đậu trái đến khi thu hoạch 95 – 105 ngày. Ưu điểm của giống sầu riêng Chuồng bò hạt lép là không bị sượng, giống này rất được ưu chuộng ở thị trường Thành phố Hồ Chí Minh, giá bán cao hơn một số giống sầu riêng nổi tiếng như Monthong, Ri6.
Sầu riêng 6 Hữu
Giống sầu riêng 6 Hữu được cho là đột biến trong tự nhiên của giống sầu riêng Khổ qua xanh vì vỏ trái của giống này có màu xanh rất giống với giống sầu riêng Khổ qua xanh. Sầu riêng 6 Hữu có nguồn gốc ở xã Long Trung, huyện Cai Lậy và hiện nay được trồng chủ yếu ở huyện Cai Lậy tỉnh Tiền Giang. Trái có trọng lượng trung bình tương đối nhỏ (1.2 – 2.0 kg), dạng thon, gai trái dài (1.6 cm) gấp đôi sầu riêng Chuồng bò hạt lép. Cơm trái có màu vàng tươi, khá bắt mắt, Brix thịt trái khá cao (trung bình 25%), hàm lượng nước trong cơm rất thấp (53%), cơm mềm, xốp, từ ráo đến hơi nhão. Tỷ lệ hạt lép tương đối thấp (16.5%) nhưng tỷ lệ ăn được khá cao (35%) do hạt nhỏ. Mặc dù có phẩm chất ngon, rất được ưa chuộng ở thị trường Thành phố Hồ Chí Minh, bán được giá cao hơn một số giống sầu riêng nổi tiếng như Monthong, Ri6 nhưng do trái nhỏ, năng suất không cao nên giống này chưa phát triển nhiều.